Boğaz ağrısı çeken hastanın yiyecek ve içeceklerine dikkat etmesi gerekir. Hastanın su alımını fazla tutması gerekmekte. Bağışıklık sistemini desteklemek için vitamin bakımından zengin ilaçlar kullanılması gerekir. Yine ileride bakteriyel enfeksiyonlara neden olmaması için boğaz ağrısının, düşük dozda geniş spektumlu ilaçlar verilmektedir.
Bakterilerin neden olduğu boğaz ağrısı hastalıklarında, bakterilerin tam olarak ne tür bakteriler olduğunu tespit etmek gerekir. Tespit edildikten sonra bakterilerin türüne göre verilen ilaçların kullanılması gerekir. Boğaz ağrısı akut bir enfeksiyona bağlıysa ve tedavi edilmezse daha ciddi sonuçlar doğurabilir. Giderek kronikleşebilecek başka enfeksiyonlara neden olabilir. Basit görülen bir virüs tedavi edilmezse kronik bir hal alabilir ve kronikleşmiş akciğer enfeksiyonlarıyla uzun yıllar mücadele verilmek zorunda kalınabilir. Eğer boğaz ağrısı sistemik bir hastalığın ilk belirtileri arasında ise çok ciddi yaşam kurtarıcı etkisi vardır.